Jeho hlavním úkolem je podporovat činnost Komise, jejího prezidenta a pracovních skupin. Sekretariát připravuje zasedání Komise a porady vedoucích delegací a také porady pracovních skupin.
Kromě toho zajišťuje oběh korespondence mezi členy Komise a také překlad dokumentů a simultánní/konsekutivní tlumočení během zasedání a porad.