Głównym zadaniem Sekretariatu jest wspieranie działań Komisji, jej Przewodniczącego oraz grup roboczych. Sekretariat organizuje posiedzenia Komisji oraz narady Przewodniczących Delegacji, a także spotkania grup roboczych.

Do jego zadań należy również zapewnienie obiegu korespondencji pomiędzy członkami Komisji, przekład dokumentów oraz tłumaczenie symultaniczne/konsekutywne posiedzeń i narad.